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揭秘小鼠失活X染色體結(jié)構(gòu)特征


                                          

      近日,安諾優(yōu)達(dá)與法國居里研究所等機(jī)構(gòu)合作,利用高通量染色體捕獲技術(shù)(High-throughput chromosome conformation capture,Hi-C)解析了小鼠失活X染色體結(jié)構(gòu)特征,相關(guān)的研究成果發(fā)表在國際**期刊Nature上。X染色體失活機(jī)制對于誘導(dǎo)多功能干細(xì)胞、克隆動物、**的診治等方面有著重要意義,一直是當(dāng)今生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。

      基因的表達(dá)與調(diào)控并不僅僅是一個線性過程,而是與染色體的三維結(jié)構(gòu)有著密切的聯(lián)系。要深入研究X染色體失活,從全基因組角度研究其染色質(zhì)DNA在空間的分布結(jié)構(gòu)以及它們之間的相互影響是必要的。目前備受關(guān)注的Hi-C是研究染色體三維結(jié)構(gòu)的技術(shù)。具體來說,它是以整個細(xì)胞核為研究對象,利用高通量測序技術(shù),結(jié)合生物信息(bioinformation)學(xué)方法,研究全基因組范圍內(nèi)整個染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系,并通過對染色質(zhì)內(nèi)全部DNA相互作用模式進(jìn)行捕獲,獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息。

      文章正是運(yùn)用Hi-C研究小鼠神經(jīng)前體細(xì)胞(NPCs)和胚胎干細(xì)胞中失活X染色體的結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)情況,揭示了X染色體沉默的機(jī)制;發(fā)現(xiàn)在失活的X染色體結(jié)構(gòu)重塑中Xist和含有DXZ4邊界發(fā)揮著重要作用,在失活的X染色體中,除了逃脫沉默的基因附近,其他位置失去了有活性和失活的區(qū)室(compartment )以及拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)域(TADs)。該結(jié)論為研究基因組空間組織和基因表達(dá)之間關(guān)系提供了強(qiáng)大獨(dú)特的模型系統(tǒng),同時有助于開發(fā)新的方法,對抗女性X染色體相關(guān)的**,促進(jìn)相關(guān)**的研究與**。

                                       

      失活的X染色體結(jié)構(gòu)特征。安諾優(yōu)達(dá)擁有豐富的Hi-C項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),物種經(jīng)驗(yàn)?zāi)依ㄕ麄€生物界,憑借**國際的Hi-C技術(shù),先后與法國居里研究所、國內(nèi)知名醫(yī)院、研究機(jī)構(gòu)等合作,目前已在Nature、Genome Biology等高水平雜志發(fā)表文章共4篇,影響因子總計64.548。安諾優(yōu)達(dá)Hi-C技術(shù)已經(jīng)**國際Hi-C領(lǐng)域的*前沿。

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